转座酶基因改变位置(例如从染色体上的一个位置转移到另一个位置，或者从质粒转移到染色体上)的j酶基因。在基因组进化过程中，转座酶基因的作用在许多方面起作用转座酶基因。最明显的效应是转座子能够启动重组，最后导致基因组重排。这种作用与这些转座因子的转座活性无关，而只是由于染色体上有某一转座因子的几份拷贝，于是在同一染色体或不同染色体上有着相同转座因子序列的部位之间发生重组。重组的结果可能会缺失若干个有重要功能的基因而出现有害效应，但有时确实也有产生了有利效应的重组。反转录转座因子的转座作用可以引起非编码序列DNA的重排，当基因组的一段DNA序列在RNA聚合酶的作用下产生其RNA拷贝，然后在反转录酶催