阿勒泰海关地处边塞，所辖吉木乃、塔克什肯、红山嘴3个一类口岸和阿黑土别克1个临时口岸，边界线长1134公里，分别与哈萨克斯坦共和国、俄罗斯联邦共和国和蒙古国接壤。2017年11月，被获评第五届全国文明单位。阿勒泰海关于1994年7月经海关总署批准，1995年3月开始筹建，1998年7月28日正式成立(处级)，隶属乌鲁木齐海关领导。下设办公室、行政财务科、稽查科、综合业务科和技术科5个科室和吉木乃、塔克什肯两个驻口岸办事处(科级)。阿勒泰海关缉私局于2000年12月31日正式挂牌成立，下设办公室、侦查科、法制科、技术情报科和查私科5个科室。目前，一关一局在编人员53人，由汉、哈、维、蒙、回、锡伯