水生生态系统平衡（aquatic ecosystem balance），农学-渔业-渔业资源-生态系统水平渔业管理科学基础-水生生态系统平衡，生态系统的物质循环、能量流动和信息传递皆处于稳定和通畅的状态。又称自然平衡[注]。在自然生态系统中，平衡还表现为物种数量的相对稳定。生态系统之所以能保持相对的平衡稳定状态是由于其内部具有自动调节（或自我恢复）能力。在水生生态系统内，各水生生物之间、生物成分与非生物环境成分之间总是在不断地进行着物质循环和能量流动。因此，水生生态系统内各个成分都处于动态变化中，即水生生态系统结构与功能都处于相应与协调的动态平衡过程，即使在外界一定强度的压力下，可以通过生态系统的自我调节能力恢复其相对稳定的状态。但是，水生生态系统自动调节能力是有限的，当外力干扰超过限度，就会破坏生态平衡，表现为结构破坏或功能衰退。造成生态平衡破坏的原因有自然灾害，也有不适当的人类活动。水生生态系统中栖息着自养生物（藻类、水草等）、异养生物（各种无脊椎和脊椎动物）和分解者生物（各种微生物）群落。各种生物群落及其与水环境之间相互作用，维持着特定的物质循环与能量流动，构成了完整的生态单元。