入侵种基因完整性（genetic integrity of invasive species），农学-植物保护学-入侵生物学-〔生物入侵效应〕-〔生物入侵影响〕-〔生物入侵生态影响〕，在种质（生物体亲代通过生殖细胞或体细胞传递给子代的遗传物质）资源保存时，要保持其群体原始遗传结构的特性，即基因型频率分布及等位基因频率分布与其源群体相一致。遗传完整性变化有两方面含义，一是贮藏过程中遗传物质的改变，如基因突变，染色体畸变等遗传变化，二是相比亲代，子代群体遗传结构发生改变。前者与储藏条件有关，后者与储藏时收集的种质资源数量和特性有关。一般情况下，外来入侵物种仅源自原产地部分种群，甚至某一种群的部分个体，不能保持其在原产地的遗传结构，但不同分布区、不同基因型的原产地种群的多次重复引入有利于入侵种维持遗传完整性，保持高的遗传多样性，甚至可以发生种内杂交，产生新的基因型，进一步提高遗传多样性。在引入阶段，也包括野外定植的初始阶段，外来种常分布在与原产地相似的环境（气候匹配假说），环境对引入基因型的影响较小，有利于入侵种群维持与源种群相似的遗传结构。