洞穴沉积物微生物(cave sediment microbes),理学-生态学-微生物生态学-微生物生态类群-沉积微生物-洞穴沉积物微生物,在喀斯特地貌形成的钟乳石、石笋等洞穴沉积物中生存的微生物。岩溶洞穴作为一个独立的生态系统,有特殊的微生物群落和环境特征。洞穴沉积物微生物能够富集洞穴渗水中的金属离子,通过生物成矿作用形成非晶质矿物质(如钟乳石、石笋等)壳覆盖于洞穴沉积物表面。因此,洞穴沉积物微生物的化学过程和协同作用可能是形成洞穴沉积物的起始性过程。开展洞穴沉积物微生物的研究将对揭示洞穴石笋中有机物的来源,微生物在石笋形成中的作用以及微生物对其他有机物的改造等具有重要价值。对洞穴沉积物微生物的研究始于1978年。研究发现芽孢杆菌(Bacillus)和假单胞菌(Pseudomonas)是洞穴沉积物中出现最多的两个属,分别有5种和6种,其次是黄杆菌属(Flavobacterium)和欧文氏菌属(Erwinia)。随着分子技术在地球科学领域的应用,一些学者开始尝试用分子生物学的方法研究洞穴沉积物微生物。