微生物流式计数法（microbiology counting by flow cytometry），工学-仪器科学与技术-计量学-生物计量-微生物计量，通过流式分析技术检测微生物光散射信号或荧光信号来测定微生物的大小、活性以及核酸的含量，并通过计数来测量微生物浓度的方法。流式分析技术（flow cytometry, FCM）是20世纪70年代发展起来的一种用于测量细胞或其他生物粒子的物理和化学特性的技术，通常以激光作为激发光源。流式细胞仪通过光学信号来反映每一个粒子的性状，每秒可对上万个细胞进行逐一检测，从而快速获得整个生物种群的参数分布特征。光散射信号反映了细胞的体积和颗粒度；荧光信号强度则代表所测细胞膜表面抗原的丰度或其核内物质的含量，由此可通过仪器检测散射光信号和荧光信号来测定细胞的大小、蛋白丰度、酶活以及核酸的含量，并通过计数分析细胞的浓度。流式分析技术最初主要应用于科学研究和临床检验，在微生物学方面的应用发展相对较晚。