微生物生理生态学(microbial ecophysiology; microbial physiological ecology; physiological ecology of microorganisms; ecophysiology of microorganisms),理学-生态学-生理生态学-微生物生理生态学,研究不同环境中微生物的生理活动特性和影响因子,探索微生物对环境的生理适应机制的学科。生态学的分支学科,微生物生理学和微生物生态学的交叉学科。微生物生理生态学是从微生物群体代谢的角度理解微生物生态现象的学科,主要研究微生物适应环境的生理机制。微生物生理生态学还是农学、林学、畜牧业、动植物(包括人类)的病理学、流行病学、传染病学、合成生物学等相关应用学科的基础。微生物学、细胞生理学和微生物生态学是微生物生理生态学的基础,分子生物学、数量生态学是提供微生物生理生态学研究方法的主要学科。