鱼类保护生物学（conservation biology of fishes），理学-生物学-动物学-脊索动物门-脊椎动物亚门，从保护鱼类及其生活环境的角度出发来保护鱼类多样性的学科。该门科学的研究对象是鱼类多样性，首先从研究鱼类多样性原理、现状和丧失的原因着手，然后从遗传、物种和生态系统等多个层次上对鱼类多样性的保护加以研究，并从政策、法律和社会关系等多方面制定和实施相应的保护措施。该学科的主要目标有3个方面：①完整记录地球上的鱼类多样性。②调查人类活动对物种、遗传变异和生态系统的影响。③建立可操作的方法来阻止物种绝灭，维持物种种群的遗传多样性，保护和恢复鱼类群落以及它们的生态功能。鱼类保护生物学是保护生物学中以鱼类及其多样性为主要保护对象的分支学科，目的在于利用分类学、生态学、进化生物学以及种群遗传学等传统学科的知识，通过保护生物学家们的努力，来阻止人为扩大的鱼类生物多样性丧失的态势。据统计，中国分布有内陆鱼类1443种，隶属于18目51科286属。长江流域分布鱼类424种，纯淡水种类361种（亚种），约占中国淡水鱼总种数的25%；特有鱼类占中国淡水鱼类总种数的43%。