植物根际微生物（rhizosphere microbe），理学-生态学-微生物生态学-〔微生物与动植物、人类关系〕-植物根际微生物，生长在植物根系周围的微生物。德国微生物学家L.希尔特纳[注]于1904年提出了根际的概念。根际是指植物根系周围受到植物生长影响的土体。这里根际植物分泌物、凋落物显著高于非根际环境。根际微生物由于生境营养丰富，数量远远大于非根际微生物，但是种类少于非根际微生物。根际微生物具有丰富的多样性，而且含有大量未培养的微生物类群。常见的细菌类群有假单胞菌属（Pseudomonas）、伯克霍尔德氏菌属（Burkholderia）、产碱杆菌属（Alcaligenes）、无色杆菌属（Achromobacter）、黄杆菌属(Flavobacterium)、土壤杆菌属（Agrobacterium）、色杆菌属Chromobacterium)、固氮菌属（Azotobacter）。常见的真菌类群有青霉属（Penicillium）、木霉属（Trichoderma）、拟青霉属（Paecilomyces）等属，还包括多种类型的菌根真菌。