水产基因组编辑（aquaculture genome editing），农学-渔业-水产养殖-水产遗传育种学-[水产育种生物技术]-水产分子育种-水产基因组编辑，利用人工核酸酶介导的编辑技术对水产生物基因组进行遗传信息改造的生物过程。如基因定点突变、基因定点插入、多位点同时突变、小片段以及大片段DNA的删除等，以获得具备优良性状的新品种。自2011年以来，基因组编辑技术已成功应用于黄颡鱼、虹鳟、尼罗罗非鱼、大西洋鲑和对虾等数十种水产养殖动物，鉴定了与性别、生长、色素、肌间刺发育等密切相关的候选基因，成为水产动物基因功能解析和遗传改良的有力工具。中国在水产动物基因组编辑方面处于世界领先地位，已在尼罗罗非鱼、鲤鱼、黄颡鱼、南方鲇、黄鳝、半滑舌鳎和对虾中建立了基因组编辑技术，这将推动中国在水产生物基础方面的研究。人工核酸酶包括锌指核酸酶技术、类转录激活因子样效应物核酸酶技术，以及成簇规律间隔短回文重复序列（CRISPR/Cas9）技术。