水生态功能分区（hydro-ecological functional regionalization），理学-生态学-〔景观与区域生态学〕-流域生态学-〔流域生态学基本概念〕-流域水生态功能分区，以淡水生态系统及其周围陆地生态系统形成的空间镶嵌体为研究对象，针对水生态系统所划分的流域生态单元分区。目的是为水环境分区分级管理提供科学依据。水生态功能分区由孟伟等于2013年首先提出。随着经济发展和人民生活水平提高，社会对人居环境的要求愈来愈高，同时国家对流域水环境管理愈来愈严。在此背景下，传统的流域水环境管理已经无法满足管理需求，需要从水质向水生态系统功能管理转变，从水陆并行管理向水陆综合管理转变。