模拟序列筛选(screening sequences in silico),理学-生物学-生物工程-蛋白质工程-蛋白质工程-蛋白质分子设计-蛋白质理性设计,针对重要疾病特定靶标生物大分子的三维结构或定量构效关系(QSAR)模型, 从现有小分子数据库中搜寻与靶标生物大分子结合或符合QSAR模型的化合物, 进行的实验筛选研究。又称虚拟筛选(virtual screening)。发展简史药物分子设计开始于20世纪60年代,应用于创新药物先导结构的发现和优化并取得突破性进展始于20世纪80年代中期,主要的推动力是分子生物学和结构生物学的发展,这使得一些靶标生物大分子的功能被阐明,三维结构被测定;计算机科学的发展导致出现了功能先进的图形工作站,极大地提高了计算和数据分析的速度和精度;许多药物分子设计新方法得以快速发展,如基于生物大分子三维结构的分子对接(molecular docking)方法和基于药物小分子的三维定量构效关系分析方法和数据库搜寻方法等。