生殖道微生物（genital microbes），理学-生态学-微生物生态学-〔微生物与动植物、人类关系〕-生殖道微生物，定植于生殖道内的所有微生物的集合。生殖道微生物固定菌群与宿主、环境之间构成了相互制约、协调的微生态系统，对维持生殖道正常生理功能和预防疾病具有重要作用。研究的最多是人类女性生殖道微生物，1892年德国妇产科医生A.杜德莱恩[注]首次发表了关于人类女性生殖道微生物的研究结果。健康女性的生殖道菌群由多种厌氧菌和好氧菌构成，其中以革兰氏阳性菌乳酸杆菌为优势菌群。这些优势菌群发挥着占位性保护等重要作用，是宿主抵御外源致病菌和内源条件致病菌的重要的生物学屏障。生殖道黏膜及其黏膜下淋巴组织与生殖道微生物菌群密切接触，相互作用，与宿主自身的免疫防御系统共同形成一道天然的微生态屏障。当生殖道微生态屏障遭到破坏时，病原菌可以趁机侵入，引起生殖道感染性疾病发作。研究表明，女性生殖道微生态失衡与细菌性阴道病、念珠菌感染及宫颈炎等疾病密切相关。