生殖独立谱系（reproductively independent lineage），理学-生态学-〔分子与进化生态学〕-进化生态学-繁育系统-生殖独立谱系，有机体生殖过程中能产生可育后代的个体集合。生物界被认为由许多不连续且客观存在的生殖独立谱系组成。对位于系统发育关系不同分支上的几个类群进行分析时，如果从种内交配得来的杂合体是可育的，但与近缘种杂交的成功率明显低，那么这个物种或集合代表一个生殖独立谱系。对400多个植物和动物属的形态学分析表明，大于80%的属都存在不连续的表型集合，但是只有不到60%的物种能对应到这些集合中，缺乏一致的对应关系主要是由于多倍体、无性繁殖及分类学家的过度分类等原因造成，但是当代的杂交事件并不构成其原因。然而，对它们的杂交可行性统计表明，植物中70%的物种和75%的表型分支都为生殖独立谱系，可代表真正的生物学类群。与传统认知相反，植物种比动物种更能够代表生殖独立谱系。