选择瓶颈效应（bottleneck effect），农学-作物学-作物种质资源-人工选择-选择瓶颈效应，由于人工选择导致某个物种种群数量骤降，群体的等位基因频率发生急剧改变，使遗传多样性水平降低的现象。经历选择瓶颈后，1个遗传多样性减少的小种群保留下来，种群基因库的变异将大大降低。当面对可选择的环境发生变化（如气候变化、可用资源的转移）时，会导致种群稳定性下降、适应和生存能力降低。如果种群数量不能得到有效恢复，就会由于遗传漂变导致基因库质量迅速降低，再经受连续的选择（掠食、灾害等）压力，种群最终可能走向灭亡。如果通过瓶颈的幸存者是基因适合度高的个体，那么基因库中此类的基因的频率就会增加，随着种群数量逐渐增加，并不断积累新的遗传变异、补充和扩大基因库的数量、提高基因库的质量，种群就会重新发展和兴旺起来。但是一般而言，经历遗传瓶颈后，种群需要相当长（多个世代）的时间恢复。