玉米自交系（corn inbred line），农学-作物学-作物-粮食作物-玉米-玉米自交系，从玉米地方品种或杂交种或人工合成群体中，经过连续多代自交并定向选择某些性状而获得的基因纯合的后代（全基因组多数位点＞93.75%以上位点，相当于F5或者BC3或更高的世代）。在育种中又称纯系。自交系不是直接用于生产，而是利用其作为父、母本配制强优势组合（杂交种）在生产上使用。杂交种的优良性状来自亲本自交系，杂交种的增产潜力取决于亲本自交系的合理组配。自交系的选育过程中，常常遇到材料的自交衰退现象。自交衰退：自交衰退是异花授粉植物如玉米等的开放授粉群体（open～pollinated population）在进行连续多代单株自交后，会出现植株生理机能的衰退，表现为植株变弱小，籽粒生活力下降、植株生长势减弱、抗病性和抗逆性下降、经济性状退化、个体和群体的产量降低。自交系间杂交或不同的地方品种间杂交，又常常显现杂种优势现象。杂种优势：杂种优势是指两个遗传组成不同的亲本（自交系、纯系）杂交产生杂交组合F1，其籽粒生活力、植株生长势、抗病性、抗逆性和丰产性等方面超过双亲或双亲平均值的现象。