代谢物检测（metabolite detection），农学-植物保护学-农业转基因生物安全学-农业转基因生物风险检测-溯源，利用生物体在生存、生长、发育和繁殖等生命活动过程中产生的中间产物或最终产物的生物、物理、化学等特性，对其结构、类型、含量等进行鉴定分析的技术。根据研究对象和目的的不同，代谢物检测可以分为四类：①靶标化合物分析。单独分析受修饰或者实验直接影响的某个或者某几个化合物。②代谢物分析。分析与已知代谢相连的一组或者几组化合物。③图谱分析。不做单个化合物的定量或者定性分析，而是广泛的分析数据，做样品的快速分类。④代谢组学分析。辐射全部的化合物类别，力求分析生物体系中所有的代谢产物，为尽可能多的化合物做定性或者定量分析，整个分析过程尽可能保留和反映总的反应产物信息。完整的代谢组学分析流程包括样品的采集、预处理、数据采集和数据的分析及其解释。代谢组学分析常用到的技术是气相色谱（GC）、高效液相色谱（HPLC）、气相色谱-质谱联用（GC-MS）、液相色谱-质谱联用（LC-MS）以及核磁共振（NMR）等。