杂交不亲和（hybrid incompatibility），理学-生态学-〔分子与进化生态学〕-进化生物学-进化-杂交-杂交不亲和，不同个体产生的配子体在受精过程中不能正常融合，或受精卵不能发育，或产生的子代无正常的繁殖能力的现象。杂交不亲和可以表现为形态特征、行为模式和基因表达等一方面或多方面的异常。根据贝特森-杜布占斯基-穆勒模型（Bateson-Dobzhansky-Muller model），杂交不亲和通常是两个及两个以上基因在不同物种中同时变异，涉及多基因之间的不兼容性，即这些基因之间在杂交个体中不能正常相互作用，导致上述不正常的繁殖和生长过程。同一基因的不同位点发生变异，也可能产生杂交不亲和。作为一种生殖隔离屏障，杂交不亲和在物种进化过程中有着重要作用。但是，两个及两个以上的基因或者同一基因内的不同位点变异需要在两个物种的所有个体中固定，才能说明是由于这些变异形成的杂交不亲和导致了种间完全的生殖隔离。如果只是在部分种群或者个体中存在差异，只能导致这些种群或个体之间的生殖隔离。