外显子洗牌（exon shuffling），理学-生物学-生物工程-基因工程，两个或两个以上不同基因的外显子异位聚集，或一个外显子进行复制，产生新的外显子-内含子结构的过程，是新基因形成的一种分子机制。又称外显子重排。发展简史1978年，美国生物化学家W.吉尔伯特[注]发现内含子在蛋白质的进化中发挥重要作用后，首次引入了外显子洗牌的概念。他指出内含子的重组可以帮助外显子独立地进行聚类，同时内含子中的重复序列有助于建立重组热点，进而驱使外显子序列洗牌。1994年荷兰学者W.P.C.施特默尔[注]等率先提出了DNA洗牌技术（DNA shuffling），即在体外使用DNA酶消化目标基因后，通过聚合酶链反应（PCR）人为地引入不同的融合和序列洗牌，使得能够在体外加速定向的分子进化，在一定程度上模仿了生物体在自然进化过程中减数分裂期时等位基因间的DNA片段交换。