作物基因型（genotype），农学-作物学-作物种质资源-作物种质资源鉴定-作物基因型，几乎不受环境影响，从亲代向子代传递的遗传物质。基因型的概念由孟德尔的“基因”概念衍生而来，基因与环境互作形成个体和群体的表型（表型），如高/矮、抗病/感病、早熟/晚熟、高产/低产、优质/劣质等，因此基因型分析成为现代育种的理论和技术支撑。作物基因型是一个个体在特定位点上的基因组成或变异，即DNA序列的变化情况。随着基因组测序技术的迅猛发展，科学家已完成大部分重要农作物（如水稻、小麦、玉米、大豆、棉花、油菜等）的基因组测序工作，基本明确了每一个物种的基因总数及品种间变异情况。每个品种拥有一套不同于其他品种的基因集合，是决定一个品种或个体表型的内因，因此有时也笼统地把一个品种称为一个基因型。