内部行政行为是“外部行政行为”的对称。发生于行政组织内部，基于行政隶属关系，是指只影响行政组织内部事务的措施。如行政首长对工作的指挥，对机关内部的组织和管理以及对下级公务员发布的命令和指示等。内部行政行为的对象是组织内部人员，但法律效果不一。主要有：（1）通令。行政领导关于某一法律和条例的解释和某项公务的实施办法，根据层级指挥权所发出的命令。适用于管辖下的全体公务员和机关，不服从命令可能受到纪律处分，但不能拘束外界人员。（2）指示。具有自由裁量权的行政机关，事先为自己及下级机关规定一个标准，作为行使自由裁量权的指导。对于指示，行政机关仍然保留着根据每个案件的具体情况，决定是否适用这个标准的权力。（3）特别的职务训令。即行政领导对个别或几个公务员的职务训令。（4）具有纪律处分性质的个别决定。如调动某个公务员的职务等。（5）机关内部组织和管理的规定等。我国行政诉讼法将内部行政行为列为不可诉行为之一，即被处分或被处理的人不服，不能申请复议，但可依照有关法律和行政法规的规定提出申诉。