1939年4月，经国民政府行政院决定在兰州建立西北技艺专科学校。1946年，经国民政府教育部批准，在兰州设立国立兽医学院。这是国内首座独立的国立兽医高等学校。首任院长为盛彤笙。同年甘肃畜牧兽医研究所并入国立兽医学院。国立兽医学院的创建，不仅是国内首座高等兽医学院，也结束了甘肃没有高等农林本科学校的历史。1947年7月，西北技艺专科学校由国民政府及其教育部直接领导，甘肃省政府协助进行，改名国立西北农业专科学校。1950年2月，撤消国立西北农业专科学校，畜牧科、草原科并入国立兽医学院。1950年12月，更名为西北兽医学院。1951年，西北兽医学院改名为西北畜牧兽医学院。1952年9月30日，经政务院批准，将西北农学院畜牧兽医系并入西北畜牧兽医学院。1958年，西北畜牧兽医学院从兰州迁到武威县黄羊镇。1958年，学校与筹建中的甘肃农学院合并成立甘肃农业大学，并迁往武威黄羊镇办学。1981年，经国务院批准学校迁回兰州办学。