地理科学学院肇始于1907年创办的“福建优级师范学堂”之史地专科。1952年福建师范学院始建地理系，1958年成立中科院华东分院福建地理所（1964年更名为福建地理研究所）；1970年（文革期间）系所均被迫停办；1972年和1982年先后复办福建师范大学地理系（后增设旅游系和土地与城市系）和地理研究所；1999年8月，由地理系和地理研究所组建地理科学学院（2004-2009年，旅游学院挂靠在地理科学学院），2019年学院被授予“全国教育系统先进集体”荣誉称号。学院以国家地理学科发展战略为导向，强化地理学与生态学的交叉，发挥闽台毗邻的地缘优势，凸显湿润亚热带区域特色，为国家人口-资源-环境协调发展提供智力保障与技术支撑。数代师大地理人励精图治，奋发图强，使得学院在学科建设、教学科研、师资队伍、人才培养等方面不断登上新台阶，已成为居全国高师同类院系前列、在我国东南部地区起学科辐射作用的地学领域人才培养基地和科研机构。