丝状真菌包括霉菌和大型真菌;霉菌，意即"发霉的真菌"，它们往往能形成分枝繁茂的菌丝体，但又不象蘑菇那样产生大型的子实体。在潮湿温暖的地方，很多物品上长出一些肉眼可见的绒毛状、絮状或蛛网状的菌落，那就是霉菌。大型真菌是指营养体为丝状菌体但繁殖体为大型子实体的类型，如伞菌由于霉菌的菌丝较粗而长，因而霉菌的菌落较大，有的霉菌的菌丝蔓延，没有局限性，其菌落可扩展到整个培养皿，有的种则有一定的局限性，直径1-2厘米或更小。菌落质地一般比放线菌疏松，外观干燥，不透明，呈现或紧或松的蛛网状、绒毛状或棉絮状;菌落与培养基的连接紧密，不易挑取;菌落正反面的颜色和边缘与中心的颜色常不一致。