铁氧化菌（FeⅡ)-oxidizing bacteria），农学-农业资源与环境-土壤学-[土壤微生物作用]-土壤铁循环-铁氧化菌，能够把二价铁氧化成三价铁从而获得能量合成有机物的微生物。通常在有氧或微氧/无氧条件下进行。铁氧化菌介导的铁氧化反应式可概括为：铁氧化菌从属于变形杆菌门、厚壁菌门、硝化螺菌门和绿细菌门。在属的水平上主要有披毛菌属、硫杆菌属、副球菌属、纤发菌属、海杆菌属、热单胞菌属、泉发菌属、万尼氏红微菌种、鞘铁菌科、绿硫菌属、小红卵菌属和红假单胞菌属。古菌域的铁氧化菌主要是来自广古菌门的铁球菌属。铁氧化菌主要分为好氧铁氧化菌、厌氧铁氧化菌和硝酸盐型铁氧化菌三种类型。厌氧铁氧化菌在自然界中种类多且广泛分布于古菌域和细菌域，细菌域包括变形杆菌门、硝化螺菌门和厚壁菌门，其中以变形杆菌门为主；而古菌域只有广古菌门的铁球菌属。硝酸盐型铁氧化菌广泛存在于河流、湿地、深海沉积物、湖泊和水稻土等各种生态环境中，主要有脱氮硫杆菌、食酸菌和嗜热古菌等。