电泳多态性是生物大分子在电场作用下，因其分 子大小、形状、空间构型及所带电荷多少的 不同，导致电泳迁移率发生变化而呈现的多 态性。蛋白质是一种典型的两性大分子，分 子中既有羧基等酸性基团，又有氨基酸等碱 基基团。一般情况下，当介质pH值大于蛋 白质等电点时，蛋白质分子带负电荷；当介 质pH值小于蛋白质等电点时，蛋白质分子 带正电荷。不同表型的蛋白质分子一级结构存在差异，分子量和等电点不同，在定pH环境中和一定的电场条件下，电泳迁移率不同，可根据蛋白谱带位置进行蛋白质多态性的分型。与蛋白质不同，DNA分子的电荷密度大致相同，迁移率主要与DNA分子长度和空间构型有关。通过选择不同浓度、不同性质的电泳介质，调整凝胶孔径大小使不同分子量和构象的DNA组分彼此分离。