定向克隆法是指对外源DNA及载体均用两种不同的限制酶消化，再将二者用DNA连接酶连接起来的方法，该法可以使外源DNA以固定的方向插入到载体中，亦可避免载体的自身环化。一般以单链噬菌体作为载体。单链噬菌体是含单链核酸的噬菌体。其中包括以f2为代表的RNA噬菌体，以φX174为代表的球状DNA噬菌体，以fd为代表的纤维状DNA噬菌体。对于一个细胞来说，内源DNA是其基因组的序列(本身生物就有的DNA)，而外源的DNA是通过基因工程导入的其他物种或细胞的DNA，也可以是人工合成的一段DNA。基因有两个特点，一是能忠实地复制自己，以保持生物的基本特征;二是基因能够"突变"，突变绝大多数会导致疾病，另外的一小部分是非致病突变。