药物代谢酶 （drug metabolizing enzyme，drug metabolism enzyme，DME），生物物理学名词，导致药物化学结构改变的酶类。药物等外源性物质在体内的生物转化可以分成两个阶段。在阶段1，外源性物质通过去烷基、脂肪酸羟基化、芳香烃氧化或脱氨使其功能基团发生改变，催化这些反应的酶称“Ⅰ期药物代谢酶(phaseⅠdrug metabolizing enzyme)”，简称“Ⅰ期酶（phaseⅠenzyme）”，如细胞色素P450。在阶段2，内源性和外源性物质转化为易于溶解的能抑制药物代谢活化的物质，即发生葡萄糖醛酸化、硫酸化、甲基化、乙酰化和巯基化，催化这些反应发生的一系列酶称“Ⅱ期药物代谢酶（phaseⅡdrug metabolizing enzyme）”，简称“Ⅱ期酶(phaseⅡenzyme)”，如尿苷二磷酸(UDP)半乳糖醛酸转移酶、磺基转移酶，N–乙酰基转移酶、谷胱甘肽S–转移酶、各种甲基转移酶(主要为硫嘌呤甲基转移酶)和儿茶酚O–甲基转移酶等，是一类重要的间接抗氧化酶。