针叶蕨细小,禾草形附生植物。根状茎细弱,横走;被粗筛孔状透明小鳞片,鳞片以基部着生,长约0.5毫米,钻状披针形。叶在根状茎上呈二列排列,相互簇生,长5-12厘米,叶片不育部分宽约0.5毫米,全缘,无毛,中脉贯通整个叶片,有1-2个短小的侧脉。孢子囊群着生于叶片下面侧脉上,每个侧脉上生一个孢子囊群,通常每个叶片有1-2枚孢子囊群,孢子囊群椭圆形,被隆起的中肋和能育侧脉外缘隆起的脊由两侧遮盖,成熟后膨起向外突出于叶边之外,呈念珠状;隔丝线形,多分节,顶端细胞几不膨大;孢子囊环带由14-16个加厚细胞组成。孢子三角圆形,三裂缝,外壁纹饰模糊。