祖师殿为供奉僧宝之处，所供者多为开辟或中兴道场之大德。彼等铁肩担道义、慈心施法雨，绍佛种、续道统，为法忘躯，兴辟道场。及至身后，万民追思。于是立殿供奉以示怀仰。祖师原来殿宇分两进，石墙铁瓦，瓦上铸有“乾隆53年（1788年）”、“道光24年（1844年）”、“同治2年（1863年）”等字样。解放后，1956年维修一次。1983年南岳管理局又重修屋舍。劈为南天门招待所的“旅游服务部”，1990年发还给南岳道教协会管理。南岳道教协会，对原来的殿宇全部推倒重来，进行重新设计，经过几年的筹备。从1998年开始动工新建，全部是石墙铁瓦，新殿于1999年8月峻工，殿宇为两进三横，建筑面积一千二百多平方米，