马鞭鱼科身体非常细长若蛇形，前半部平扁，後半部成圆柱形，吻部细长如同一根吸管。口极小，位于吻部前端，又称为「端位」。没有牙齿，下颌无须，鱼鳃没有具滤食功能的鳃耙。马鞭鱼全身光滑无鱼鳞，或是覆盖著细小的棘刺，具侧线。背鳍没有硬棘，有软鳍条13-20条，臀鳍之软鳍条也有 13-20 条，与背鳍的上下位置相对。尾鳍中间凹入成叉形，尾鳍的特征为：中间有两条软鳍条特别长，像丝状一般随著游动方向摆动。马鞭鱼科鱼类分布广泛，在世界各热带海域都可看到它的踪迹，主要栖息鱼沿岸的珊瑚礁或岩礁水层中或近海较深水域。常单独出现但有时也会成群出没。属肉食性鱼类，以无脊椎动物与小鱼为主食，使用长吻吸食猎物。全世界共1属4种，台湾即有2种。体延长，前方平扁，后方圆柱形。吻延长为管状。口极小，端位。无齿。下颌缝合部无须。无鳃耙。体裸露无鳞 ，或被以细小棘刺 ；具侧线。背鳍无硬棘，软条13-20；臀鳍与背鳍相对，软条13-20；尾鳍凹入，中央二鳍条延长为尾丝。全世界共1属4种（Nelson， 2006），纪录1属2种（Shen et al.， 1993；鱼类数据库， 2006）。