吴毓兰（？-1882年），字香畹，清代合肥（今属肥东县）人。清朝淮军将领。咸丰十年（1860年），吴毓兰集团练解寿州围。同治元年（1862年），从淮军援上海，以战功擢知县。同治二年（1863年），加同知，领华字副营，调守嘉善。同治三年（1864年），吴毓兰从程学启陷嘉兴，擢知州。败太平军于溧阳，守长兴，战泗安，擢知府。同治四年（1865年），调守扬州，移庐州。次年，回守扬州。清廷追论其在浙西战功，以道员选用。同治六年（1867年），俘获捻军首领赖文光，以道员记名。同治七年（1868年），加布政使衔。同治八年（1869年），为李鸿章办理海防营务，管天津机器局。光绪六年（1880年），授天津河间兵备道。光绪八年（1882年），吴毓兰去世。咸丰十年（1860），太平军、捻军合扰皖北，吴毓兰以从九品的身份，和哥哥吴毓芬训练团练，助剿凤阳、颍州之间，跟随官军解寿州之围，擢县丞。