菌落形成单位(CFU，Colony-FormingUnits)指单位体积中的细菌、霉菌、酵母等微生物的群落总数。在活菌培养计数时，由单个菌体或聚集成团的多个菌体在固体培养基上生长繁殖所形成的集落，称为菌落形成单位，以其表达活菌的数量。菌落形成单位的计量方式与一般的计数方式不同，一般直接在显微镜下计算菌体数量会将活与死的菌体全部算入，但是CFU只计算活的菌体数量。菌落的个数，传统上叫"个"。但是，一个菌落并不一定是一个细菌所生成，也可能是由一簇细菌(一个细菌团)所生成，因此叫"个"不太准确，准确的叫法是"菌落形成单位"。就像"公斤"和"千克"，只是叫法不同，数量上没有变化。