工程学院的前身是始建于1980年的海洋工程系，经过三年筹建，从1983年开始招生，1993年成立工程学院，目前已发展成为以海洋为特色的、人才培养与科学研究协调发展的高水平工科学院。学院现设有海洋工程系、土木工程系、机电工程系、自动化及测控系四个系，拥有较为完整的人才培养体系。设有8个本科专业，分别为港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程、土木工程、工程管理、机械设计制造及其自动化、工业设计、轮机工程、自动化;设有5个一级学科硕士授权点，分别是船舶与海洋工程、水利工程、土木工程、机械工程、控制科学与工程;设有6个专业硕士学位授权点，分别是水利工程、船舶与海洋工程、建筑与土木工程、动力工程、机械工程、