水生生态系统演替（aquatic ecosystem succession），农学-渔业-渔业资源-生态系统水平渔业管理科学基础-水生生态系统演替，一定区域内的水生生态系统中生物群落及非生物环境随时间而发生的规律变化，由一种类型转换为另一种类型的生态过程。又称水生生态演替。是水生生态系统在不同时间尺度上发生的规律变化过程。这种时间尺度可以是数十年，也可以数百万年。水生生态系统演替的发生与发展离不开生物群落对物理环境的改造过程。随着演替的进行，水生生态系统的结构（营养结构和空间结构）变得越来越复杂，空间异质性的增加和生态位的狭小化促使生态系统中的生物多样性越来越高，栖息地各种水生生物可以在系统内部完成能量流动和物质循环过程，从而形成顶级生物群落和生态系统。热带珊瑚礁和发育良好的红树林生态系统就是典型的顶级水生生态系统。水生生态系统演替的类型多样。按演替发生的起始条件可以将水生生态系统演替划分为原生演替和次生演替。在一个从未被占据或一开始时没有任何生命成分的水生环境中发生的演替就叫原生演替。在一个受到干扰或被破坏的水生环境中发生的演替叫次生演替。