物种2000（Species 2000），理学-生态学-〔生物多样性与保护生态学〕-保护生态学-〔生物多样性编目与监测〕-生物多样性编目-物种2000，非营利性的全球生物多样性数据库组织。20世纪90年代早期，国际科学技术数据委员会（CODATA）、国际生物科学联合会（IUBS）和国际微生物学会联合会（IUMS）一起开始着手实施物种2000项目。1996年在菲律宾马尼拉举办的研讨会中，来自18个分类数据库机构的代表决定设立物种2000机构，以促进物种2000项目的实施。组织的目的是搜集全球物种数据，创立具有统一形式并经权威认可的电子名录索引，涉及类群包括植物、动物、真菌以及各类微生物。物种2000拥有一个分散式的秘书处，日常行政事务由设立在荷兰的自然生物多样性中心（Naturalis Biodiversity Center）主持，编辑办公室设立在美国的伊利诺伊州自然历史观测机构（Illinois Natural History Survey），数据管理由鱼类数据库信息与研究机构（Fish Base Information and Research Group）负责。