内转录间隔区(internal transcribed spacers; ITS),理学-生物学-微生物学-微生物分类学-〔分子系统学 〕,位于染色体上核糖体RNA(rRNA)小亚基和大亚基基因之间的间隔区域。简称转录间隔区。原核生物基因组中内转录间隔区(ITS)位于16S rRNA基因与23S rRNA基因之间,只有1个;而真核生物的内转录间隔区包括两个ITS(ITS1、ITS2),中间是5.8S rDNA,其上游是18S rDNA,下游是28S rDNA。该区域长度一般为500~700碱基对。与ITS相对应,在18S rDNA上游和28S rDNA下游是外转录间隔区(external transcribed space; ETS)。ETS无分类学意义,分类学所指的ITS便是内转录间隔区。就进化速率而言,ITS序列较18S rRNA基因快,许多研究表明其变异程度表现出种内相对一致,而种间差异较为明显。因此,ITS是生物分类与鉴定有价值的分子标记。原核生物基因组较小,序列分析较为方便,用ITS序列进行细菌和古菌分类与鉴定的较少,仅为辅助之用。