酶切位点预测(protease cleavage sites prediction),理学-生物学-生物工程-蛋白质工程-蛋白质工程-蛋白质分子设计-蛋白质理性设计-蛋白质基本理化性质预测,根据蛋白酶的裂解特异性信息,对目的蛋白质序列中可能的蛋白酶切割位点的预测。基本内容蛋白酶介导的蛋白质水解是细胞中重要的生物过程,通过切割蛋白质氨基酸残基的共价键而将蛋白质分解为多肽。蛋白酶还通过释放前肽和靶向信号在酶的激活中起主要作用。蛋白质分解在细胞周期、细胞死亡、途径调控、蛋白质降解和炎症反应中起着重要作用。国际上的研究者已经鉴别了数百种蛋白酶,许多蛋白酶具有特定的结构和序列特征,并具有高度的底物特异性,对蛋白酶结构和水解机制的认识有利于计算机分析和表征蛋白酶特异性切割位点。研究蛋白酶底物特异性的实验技术主要有N端肽鉴定法、一维和二维凝胶法、高通量质谱技术等。但是用实验方法鉴别蛋白酶切位点依然是一项耗时费力的难题,利用酶切位点预测方法能够极大减少实验工作量,已经开发了许多计算方法进行酶切位点预测。