微生物源追踪(microbial source tracking),理学-生物学-生物工程-基因工程,追踪水体微生物污染来源的方法或过程。又称微生物溯源。分类主要分为两类,即库依赖法和非库依赖法。库依赖法指的是菌株水平的分析,即将从不同种属动物的粪便或采集的水样中分离得到的菌株进行培养,并根据菌株与菌株之间的特征或统计方法匹配,从而得到相应的污染源类别。库依赖法常使用的微生物指示菌包括埃希氏大肠杆菌、粪大肠杆菌、粪链球菌、肠球菌和大肠杆菌噬菌体等。常用的方法有表型法和基因型法两类,使指示生物表现出自身的特征。这种方法需要建立菌株数据库或者根据已知来源的粪便指示菌建立种属源数据库,因而被称之为库依赖法。非库依赖法指的是样品水平的分析,利用某种属特异的基因标志物来检测样品DNA,从而判断该样品中是否存在该种属粪便污染。