肠道集合淋巴结是肠黏膜免疫系统的重要组成部分，是小肠粘膜内的一组淋巴滤泡。淋巴滤泡由B细胞和T细胞(CD4为主)组成，在其表面覆盖着一层微皱褶细胞，又称M细胞。它能识别胃肠道内呈现的许多抗原，主要吞噬病毒和肠道病原菌，递呈吞入的肠腔内抗原转交给免疫细胞，免疫细胞可对致病抗原加工、转运、呈递。M细胞存在于淋巴滤泡上皮之间，与肠上皮细胞紧密排列在一起，形成上皮屏障，并与其口袋中的各种淋巴细胞紧密接触，肠腔中的大部分病原体是由M细胞转运的，表明M细胞的主要功能是摄取并转运抗原(尤其是颗粒性抗原)至其下的免疫细胞。