巴拿马运河吨位（Panama Canal Tonnage）是巴拿马运河管理当局根据《巴拿马运河船舶吨位丈量规则》丈量的船舶吨位，并据此颁发巴拿马运河吨位证书。凡通过巴拿马运河的商船，必须缴验《巴拿马运河吨位证书》，并据此纳税，否则重新丈量并颁发证书。“巴拿马运河船舶吨位丈量规则”于1994年10月1日起与国际船舶吨位丈量公约接轨。巴拿马运河吨位（Panama Canal Tonnage）指渔船检验机构依照《巴拿马运河船舶吨位丈量规则》对在巴拿马运河航行的船舶进行巴拿马运河吨位丈量后获得的吨位数值，并且会颁发相应的巴拿马运河吨位证书。依照巴拿马运河管理当局的规定，凡通过巴拿马运河的船舶，必须向该运河管理当局提交巴拿马运河吨位证书。运河当局有权进行复核，并按船舶的巴拿马运河吨位收取通行费。凡需通过巴拿马运河的远洋渔船均应向渔船检验机构申请巴拿马运河吨位证书。