有效种群（effective population），理学-生态学-〔生物多样性与保护生态学〕-保护生态学-〔生物多样性保护与管理〕-〔生物多样性保护策略与方法〕-就地保护-〔种群水平就地保护〕-有效种群，在没有选择、突变和迁移的理想情况下，种群大小稳定，世代之间没有重叠，种群的全部个体能随机交配，所有个体能以相同的概率给下一代贡献配子的种群。然而，在自然情况下，由于种群大小波动，不同世代之间有重叠，参与繁殖个体的性别比例相差很大，参与繁殖个体对下一代贡献不等，有效种群大小通常远低于实际的种群大小，而影响进化过程的种群仅由那些参加繁殖的个体所构成，这部分个体的数量即为有效种群大小（）。它决定了种群平均近交系数和遗传漂变，进而影响种群遗传结构中杂合度、等位基因数、等位基因及基因型频率等种群遗传特征的变化。有效种群大小（）最早由美国遗传学家S.G.赖特[注]提出，后来根据种群结构、种群类型的不同发展出了不同的类型。根据不同的遗传特征，Ne常被区分为近交有效群体大小（inbreeding effective size,）和方差有效群体大小（variance effective size,）。