棉花育种（cotton breeding），农学-作物学-作物-纤维作物-棉-棉花育种，通过引种驯化、定向选择、人工杂交及其他手段改造棉花的遗传特性，培育出在产量和产品品质上能满足生产、加工和消费要求的优良棉花品种的过程。发展简史棉花共有4个栽培种，其中两个是二倍体棉种，即非洲棉［Gossypium herbaceum，（A1）］和亚洲棉［Gossypium arboreum，（A2）］；两个是四倍体棉种，即陆地棉［Gossypium hirsutum，（AD）1］和海岛棉［Gossypium barbadense，（AD）2］。在全世界棉花生产中，陆地棉种植最多，占世界棉花总产量的90%；其次为海岛棉，约占5%～8%；亚洲棉约占2%～5%；非洲棉已很少栽培。亚洲棉和非洲棉虽然只在很少地区种植，但在棉花育种中是有价值的种质资源。世界各主要产棉国都以培育新品种作为提高单产和改进品质的重要措施。四倍体的陆地棉和海岛棉是世界各国主要栽培种，二倍体栽培种亚洲棉和非洲棉只在局部地区种植，因此，棉花育种工作主要是培育陆地棉品种，其次是海岛棉品种。美国是最早开始陆地棉育种的国家。