水生菌物（aquatic fungi），理学-生物学-微生物学-微生物分类学-〔真菌的分类〕，生活在水体中并能完成其全部或部分生活史的菌物。广义的水生菌物包括淡水菌物、海水菌物和污水菌物；狭义的水生菌物仅指淡水菌物。由于长期适应水环境，它们形成能在水中游动的游动孢子、游动配子、游动合子以及便于漂浮和栖息的丝状孢子、四枝孢子、星状孢子等。淡水水生菌物是一个种类繁多、数量庞大的类群，其全部或部分生活史依赖于淡水环境，大约有3100种，包含壶菌、卵菌、担子菌、接合菌、子囊菌等。淡水水生菌物的生活、生长和繁殖等一系列必要条件都要依靠淡水的环境提供，其栖息地一般可分为三种：①动态水环境，如小溪、江、河。②静态水环境，如湖泊、池塘、沼泽以及地面低洼处形成的水坑等。③中间性水环境，如江、河、湖、溪的岸边区域和洪水淹没区域等陆地和水的交接处。水生菌物的分布受多种因素影响，如水中的基物、水层的深浅、水的清浊等。