丽江素有“药材之乡”的誉称。丽江境内有药材2010种。按水平分布，以玉龙山为界，可分为东西两片。西片特产猪苓、竹红蕈、滇豆根、黄射干、三尖杉、五倍子、榧子等。东片特产天冬、穿山甲、菟丝子、五灵脂、麻黄、佛手、龙骨、黄药子、金丝马尾黄连。 按垂直分布，玉龙山为标志，海拔2000米以下的金沙江畔，亚热带代表药材天花粉、川楝子、蜈蚣、斑蝥虫、楣子、桔梗、茯苓、三七、丹皮，白胶香、山慈菇、龙衣、谷精草，蜜蒙花、滑石。海拔2000～3000米为高山温凉地带，代表药材当归、人参、西洋参、木香、秦艽、鹿仙草、珠子参、紫丹参、叶三七、麝香、熊胆、猴骨。海拔4000米为高山寒湿地带，代表药材虫草、贝母、岩菖蒲、雪茶、雪莲花、缘绒蒿等。在纳西族民间，有自挖、自制、自用药物的传统历史。清代道光年间，纳西族名医和介山、习谭对丽江药材精心研究，发掘了本地药材加工施用，其他药号亦自采、自制。