配子体发达，圆柱形或扁平，单条，丛生，幼时中实，其后中空，通常缢缩成节或不缢缩。基部尖细，具有小盘状固着器附着在基质上。孢子体皮壳状，小型。生活史为配子体发达的异形世代交替。生长方式初为毛基生长，后为居间生长。髓部是由大而无色的薄壁细胞组成的，内皮层也由无色薄壁细胞组成，但比髓部细胞小;表皮细胞小，排列较整齐，每个细胞含有1个色素体和蛋白核。无色毛单生或丛生。多室囊单列，由表皮细胞发育而成，多室囊之间有棒状隔丝，散布于藻体表面，单室囊至今没有发现。该属现有萱藻、无隔萱藻和卷曲萱藻3种，都是海产。其中无隔萱藻只见于美国加利福尼亚沿岸，卷曲萱藻只见于南极福克兰群岛。中国只有萱藻1种，藻体褐色，直立