原肠胚(gastrula)是指具双胚层或三胚层的动物胚胎。动物胚胎发育的一个重要阶段。由囊胚发育而来。囊胚的部分细胞通过种种方式迁移到内部，形成双胚层或三胚层的原肠胚。低等动物如腔肠动物仅有两个胚层组成;许多高等动物则在肉外胚层之间形成了中胚层。内胚层所包围的腔称原肠腔。原肠胚形成中的细胞迁移称原肠作用。其方式多样，有内陷、外包、分层、移人、集中、延伸等。在这时期，细胞核开始起主导作用，合成新的蛋白质，细胞分化显著，为组织发生、器官发生打下基础。从扁形动物开始，多细胞动物的胚胎发育过程出现了中胚层，从而引起了身体结构上的复杂分化，这在动物的进化史上是个重大的发展。