操纵子，是指启动基因、操纵基因和一系列紧密连锁的结构基因的总称，是转录的功能单位。操纵子通常由两个以上的编码序列与启动序列、操纵序列以及其他调节序列在基因组中成簇串联组成。启动序列是RNA聚合酶结合并启动转录的特异DNA序列。多种原核基因启动序列特定区域内，通常在转录起始点上游-10及-35区域存在一些相似序列，称为共有序列。操纵序列是原核阻遏蛋白的结合位点。当操纵序列结合阻遏蛋白时会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合，或使RNA聚合酶不能沿DNA向前移动，阻遏转录，介导负性调节;另有一种特异DNA序列可与激活蛋白结合，使转录激活，介导正性调节。原核生物大多数基因表达调控是通过操纵子机制实现的，