克隆选择（Clonal selection）又称株落选择，于1957年由澳大利亚的Burnet和Jerne共同提出。他认为免疫细胞可以随机生成多样性的克隆，每一个免疫细胞的克隆表达针对某一个特定抗原的特异性的（Specific）受体（Receptor）。对于某一特定抗原，该抗原与表达其特异性受体的免疫细胞发生特异性结合，导致此种免疫细胞被活化并大量扩增。不同的抗原活化不同的免疫细胞克隆。免疫耐受（Immunological tolerance）是由于免疫细胞克隆发生了夭折，即与自身抗原结合的免疫细胞在扩增的前体细胞（Precursor or Progenitor）阶段发生了流产。