庄祖诲（？－？），字汝格。莆田人，迁四川成都，军籍 。弟庄祖诰。万历二十二年（1594）四川乡试举人。万历三十二年（1604）杨守勤榜三甲第5名进士。任嘉兴府（今属浙江）知府。万历四十七年（1619）九月任山东河工副使。崇祯三年七月任浙江右布政使。崇祯四年（1631）升浙江左布政使。崇祯四年至六年（1631－1633）任应天巡抚，治水患，兴水利，政绩有声。崇祯五年，巡抚庄祖诲督通判朱启元浚华亭祝家港，浙河，长三千六百余丈，上海新场河，沈庄河，青浦蒲汇塘，长四千八百余丈，筑泖塘淀河岸，长二千八百余丈。廉明能恪，任内恶其养盗肆奸，遂毁庵惩众，具疏以闻。后任户部侍郎。善治水，崇祯十四年（1641）作《程邑侯水利功德碑》。崇祯十五年（1642）庄祖诲督剿寇饷，忧为盗劫，远避之长沙、衡州。卒后赠南京户部尚书，荫子入国子监。